Le Musée Damien fonctionne sur la base d'une vision contemporaine et stimulante de la figure de Damien, basée sur des recherches scientifiques expertes et récentes en Belgique et à l'étranger. Cette vision contemporaine présente la figure de Damien comme un bâtisseur inspiré de ponts entre les cultures et les religions et comme un activiste engagé des droits de l'homme avant la lettre, sans négliger le processus d'apprentissage et de croissance que Damien a traversé en tant que personne et qui a fait de lui ce qu'il était et ce qu'il a fait. Aux yeux des Hawaïens, il a incarné de nombreuses valeurs hawaïennes importantes telles que l'amour et la compassion (aloha), l'unité et l'appartenance (ohana), la considération et l'attention pour tous (malama pono).
Le Père Damien (1840-1889) a beau avoir vécu il y a deux siècles, son message et ses valeurs de sens, de lien, de respect, de dialogue, de solidarité et d'engagement au-delà des frontières restent d'une brûlante actualité. Il s'est laissé toucher par l'histoire des personnes en marge de la société. Il a reconnu leur dignité. Il a partagé sa vie avec eux. Il s'intéressait aux personnes dans toute leur diversité (matérielle, physique, mentale, spirituelle) et s'engageait activement en faveur de leurs droits. Aujourd'hui encore, de nombreux facteurs et circonstances (pauvreté, maladie, solitude, chômage,...) font que des personnes sont mises à l'écart et exclues de notre société. Aujourd'hui encore, Damien, élu Grand Belge en 2005 et canonisé en 2009, son héritage et son legs savent nous inspirer et nous engager à propager activement ses valeurs et à leur donner corps dans notre société contemporaine et à lutter activement et pacifiquement contre l'injustice et l'exclusion et à œuvrer pour une société juste et humaine.
Cette vision de Damien et la manière dont il réussit à inspirer des personnes et des organisations comme le Musée Damien aujourd'hui sont ancrées dans une « vision intégrale » de l'héritage. L'attention portée au patrimoine et à l'héritage de Damien se traduit automatiquement et directement par l'attention portée aux valeurs actuelles de Damien et par l'attention portée aux personnes. Cette triple attention constitue l'unité directrice du Musée Damien et de ses activités patrimoniales. Les concepts clés sont l'inclusion, la participation, l'accessibilité, l'hospitalité, la durabilité et l'engagement.
Le Musée Damien est plus qu'une simple réserve du passé. Comme tant d'autres musées et institutions patrimoniales, le Musée Damien est une maison d'apprentissage qui forme la personne et la communauté, un lieu d'information, d'inspiration, de réflexion, de dialogue, de participation et d'engagement.